重点实验室对外学术交流活跃，主要学术交流情况如下：

浮游生物生态学研究团队近年来多次赴澳大利亚访问，旨在“中澳近海健康生态研究”项目工作以及中澳联合研究中心建设的进一步推进，代表团先后赴布里斯班和澳大利亚海洋研究所，就双方在各自已有的研究结果进行深入交流，为下一阶段研究合作目标建立合作计划；此外，相关团队应邀赴美国伍兹霍尔海洋研究所开展关于浮游生物生物物理学的合作交流，同时向对方介绍我国在浮游生态学方面的研究进展，该次出访对重点实验室在浮游动物行为生态学研究方面起了很大的推动作用。

赤潮防控研究团队赴智利开展有害藻华治理技术服务，与当地就智利近岸有害藻华对该国养殖业的威胁及防控需求、改性粘土治理技术在中国的应用情况以及在智利的推广等议题，开展了密切而广泛的沟通；举办了五场技术服务会，向智利广大养殖企业和用户讲解了改性粘土治理藻华的技术要求和实施规范，并开展现场示范应用；中国驻智利大使馆向我国科技部发送了要文，指出“这是中国科学家首次携自主知识产权的环保技术走进智利，为两国在环保与可持续发展领域务实合作树立起良好范例”，标志着我国具有独立知识产权的藻华治理环保技术成功走出国门、落地智利。2017年11月，美国佛州近海暴发大规模赤潮，持续近1年，导致大量海生物死亡和经济损失，对人类健康构成威胁，在全球范围内引起广泛关注，为此，WHOI和实验室相关团队签署使用中国改性粘土技术的合作协议；2018年12月该团队赴美开展了现场示范应用。

深海生态系统研究团队赴新西兰水域和大气国家研究所（NIWA）访问，双方交换了在深海尤其是在深海海山、冷泉、热液等方面研究的最新进展，商讨制定未来合作计划等，讨论并制定了未来的合作计划，特别是海洋所和NIWA深海研究项目中的进一步合作，为双方共同研究西太平洋生物多样性与生态系统建立了合作关系。

浮游植物生理生态学研究团队成员应美国石溪大学海洋与大气科学学院副院长Christopher J. Gobler教授的邀请，赴美开展合作研究，双方的主要研究领域为赤潮生态学，合作研究内容为通过多种分子探针研究多环旋沟藻毒素和化感物质的化学本质，并通过应用一系列的化学分子探针对该藻所产的毒素和化感物质的化学性质做进一步研究；此外，应澳大利亚Flinders University理学与工程学院前院长Jim Mitchell教授邀请，团队成员还访问了Flinders University，与该大学进行了关于人才联合培养和研究合作的深入交流，并作了题为“休眠孢囊与甲藻有害藻华的年际复发与地理扩散”的学术报告。

浮游生物生态学团队成员前往英国圣安德鲁斯大学、南安普顿大学国家海洋中心等，实施英国实施基金委国际合作与交流中英水母减灾相关研究项目，通过西苏格兰和中国沿岸海域暴发水母种类的多样性与种群遗传多样性的比较研究，加深对各自暴发机理和暴发水母种群扩散机制的理解。

2015年10月22日，日本东京大学渡边良朗教授来访，并做了题为：Recruitment variability of small pelagic fish populations in the western North Pacific的学术报告。渡边教授曾任日本海洋学会会长，长期从事鱼类生物学、海洋生物资源生态学及相关领域研究，在日本国内及国际上具有较高声誉和影响力。此次访问对于双方今后互相合作提供了良好沟通平台。

2015年12月2日-11日，海洋有害藻华研究领域国际著名专家、“Harmful Algae”主编、美国纽约州立大学石溪分校海洋与大气学院副院长Christopher J. Gobler教授来访，受邀为重点实验室和研究生部联合举办的“2015近海生态系统演变高研班”作了两场重要学术报告，与我国海洋生态学研究工作者就国际有害藻华研究前沿和热点开展了广泛的交流和讨论，同时，还就专业学术论文写作同我室科研人员和研究生进行了深入的交流。

2016年3月21日-26日，国际知名的藻类生理学专家、“Harmful Algae”主编、美国康乃狄格大学海洋科学系Sandra E. Shumway教授来访，访问期间，Shumway教授与重点实验室科研人员就国际有害藻华研究前沿和热点开展了广泛的交流和讨论，并向青年科研人员和研究生系统介绍了学术论文的组织、撰写、发表等关键环节。2018年5月，Sandra E. Shumway教授再次来访，作为特邀嘉宾，参加了中科院海洋所学术报告月活动。

2017年7月13日，法国驻华使馆科技专员Sophie de BENTZMANN女士访问了重点实验室，实验室成员介绍了与法国Aix-Marseille大学Gérald GREGORI教授长达十余年的合作历史，包括双方联合培养博士、共同申请项目、合作发表文章合作交流成果等，提出了下一步计划建立中法联合实验室的构想。Sophie de BENTZMANN女士介绍了法国使馆科技处的相关信息、对中法合作交流相关资助项目等。

2017年9月6日至9月12日，澳大利亚海洋研究所的Richard Brinkman教授和Patrick Laffy教授访问了重点实验室，参加中澳政府间合作“中澳近海生态系统健康联合评估”项目推进交流会议，并发表题为Viral metagenomics in sessile invertebrates from coral reef ecosystems的学术报告。中澳双方成员就各自研究方向的研究进展以及在中澳合作项目开展的工作进行深入交流，对项目进一步工作推进的具体安排进行讨论并达成共识。

2018年4月11日-18日，水产病害研究领域国际知名专家、美国弗吉尼亚海洋研究所Hamish J. Small研究员来访实验室，并作了题为“Transmission of Hematodinium spp. in juvenile blue crabs Callinectes sapidus”的学术报告，与重点实验室相关科研人员就养殖虾蟹感染寄生性甲藻的流行病学、病理学和免疫学等问题开展了广泛的交流和讨论。

此外，实验室还与美国麻省大学、马来西亚马来亚大学、英国东英吉利大学、日本东京大学、法国艾克斯－马赛大学、韩国海洋水产部、澳大利亚海洋科学研究院等本领域国际知名研究院所建立了合作关系，开展了一系列的学术访问和交流。